旺宏教育基金會長期專注於科學人才的培養，因此針對不同年齡學子持續規劃各類型知識工程活動。為啟發全國高中職學生對自然科學與應用科學的興趣，並鼓勵高中生探索科學的精神與創造發明的潛力，培養學生靈活思考、多元學習的精神。2002年邀請暨南大學榮譽教授李家同教授擔任召集人，並與中央研究院特聘講座劉兆漢院士、東海大學物理系王亢沛榮譽教授、元智大學張進福校長及清華大學孫運璿榮譽講座陳信雄教授共同組成召集委員會齊力推動，舉辦第一屆「旺宏科學獎」，至今已邁入第十三屆。本屆由吳妍華校長接任召集人，號召科技部林一平次長、中山大學楊弘敦校長、中央大學李光華副校長及清華大學潘晴財教授，為旺宏科學獎共盡心力。

「旺宏科學獎」提供全台灣高中職學生一個跨校良性競爭的環境及成果發表的園地，辦理十三屆以來，每屆參與同學持續增加，至第十一屆已累計逾10,000人次參與，獲得學校、師長、同學及家長的高度重視，更被老師們稱為高中職的「諾貝爾獎」。

旺宏科學獎得獎同學將可獲得大學四年最高新台幣四十八萬元之獎學金補助，以及由五位科學獎召集委員聯名的推薦信函，鼓勵同學繼續在科學領域的持續探索，並提供實質幫助。自第四屆起，旺宏科學獎對於學校與指導老師也設置獎勵，感謝他們對鼓勵科學教育及創新的努力。

為延續「旺宏科學獎」的精神，基金會更於2004年9月成立為每屆獲獎同學專屬的「旺宏科學獎聯誼會」，透過定期舉辦各項活動與年會，加強交流，希望讓更多創新的種子在臺灣這片土地成長。